Партнёрами Центра являются:
- Вильнюсский университет (Vilniaus Universitetas)
- Мурманский арктический государственный университет
- Дальневосточный федеральный университет — Школа экономики и менеджмента
- Рыбопромышленная и рыбообрабатывающая компания ООО «Витязь-Авто»
- Этномастерская «Тепло Лапландии»
- Консалтинговая компания “4SeaSolutions“
- Академия наук Республики Саха (Якутия) — соглашение о сотрудничестве
- Региональный общественный фонд поддержки экспедиционной деятельности «Арктика» — соглашение о сотрудничестве
- Общественная организация «Национальный совет КМНС»